Slovenské železnice sa stretávajú s rôznymi problémami a výzvami. Niektoré časti železničnej infraštruktúry sú zastarané a vyžadujú si modernizáciu a opravy. Staršie trate môžu byť obmedzené v rýchlosti a efektívnosti, čo môže ovplyvniť spoľahlivosť prepravy.